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主题:全球最大数字微生物数据库建成
科技日报
来自爱尔兰、法国和意大利的科学家携手,成功构建了全球最大的数字微生物库——“阿波罗”(APOLLO)。“阿波罗”囊括了247092个计算模型,其中包含迄今为止最全面的人体微生物组计算模型,有望增进科学家对人体微生物组及其对健康影响的理解。相关论文发表于最新一期《细胞系统》杂志。
研究团队重点关注了细菌微生物组,即那些栖息于人体内外的细菌群落。他们基于真实样本,创建了14451个微生物群落的计算模型,每个模型都展示了这些群落内不同微生物代谢如何随身体部位、年龄和健康状况的变化而变化。这些计算模型依据的样本分布身体不同部位,跨越不同年龄,是迄今最全面的人类微生物组计算模型的集合。“阿波罗”还预测了与克罗恩病、帕金森病和儿童营养不良有关的关键代谢物,为开发诊断和治疗新策略提供了宝贵线索。
研究团队表示,这一数据库将成为科学家探索微生物在人体内功能、微生物与健康和疾病相互作用的新利器,降低对繁琐的活体生物实验的依赖。
这一成果基于团队长达十年的专业知识,从早期涵盖数百种微生物的“重建和分析肠道微生物代谢”(AGORA)项目,到涵盖数千种微生物的AGORA2,再到现在的“阿波罗”。
研究团队表示,通过识别微生物代谢标志物,“阿波罗”可以帮助科学家开发非侵入性诊断工具,更早且更准确地诊断出疾病。这些模拟还能预测个体的微生物组与其饮食、药物和健康状况之间的相互作用,带来更具针对性的益生菌、益生元和基于微生物组的个性化疗法,帮助个人优化肠道健康,更有效地治疗特定疾病。
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